Fljótsdalshreppur rekur grunn-og leikskóla á Hallormsstað í samstarfi við sveitarfélagið Fljótsdalshérað.

Fljótsdalshreppur er samstarfsaðili að eftirtöldum stofnunum:

Brunavörnum á Héraði

Félagsþjónustu Héraðssvæðis

Dvalar-og hjúkrunarheimili aldraðra á Egilsstöðum

Skólaskrifstofu Austurlands

Markaðsstofu Austurlands

Þróunarfélags Austurlands

Héraðsskjalasafni Austfirðinga

Minjasafni Austurlands

Heilbrigðiseftirliti Austurlands